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中国现代家犬线粒体全基因组研究获停顿

2020-01-14 古脊椎植物与先人类研究所
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  2020年18日,《分子生物学与退化》(Molecular Biology and Evolution)在线发表了中国迷信院古脊椎植物与先人类研究所古DNA实验室研究员付巧妹团队与中国迷信院昆明植物研究所陕西省考古研究院浙江省文物考古研究所兰州大年夜学和四川大年夜学等协作完成的关于中国现代家犬线粒体全基因组的研究成果。研究成果注解,所取得的26例中国现代家犬线粒体基因组大年夜多(18/26)属于A2单倍型,并且能够与现生的澳洲野犬及宁靖洋岛屿殖平易近时代之前的家犬直接相干。研究推想A2单倍型的家犬能够曾广泛分布于长江黄河道域并占据主导地位,前期分散到中国南边西北亚新几内亚澳大年夜利亚及宁靖洋的岛屿上。

  东亚南边是遗传学研究认为的家犬能够的来源地,然则与考古学的证据相抵触。家犬的现代遗存在中国南方地区较为罕见,并且相对时间也较早,所以植物考古学研究更偏向于认为家犬来源于中国南方,或许起首在中国南方出现。中国南边地区能够是遭到骨骼遗存保存条件的限制,发明于浙江田螺山遗址距今约7000年前,属于新石器时代较早期的遗址之一。这一遗址发明的田螺山个别在搜集构造图上处于一切A2单倍型个别的中间肠位,及在体系退化树上处于一切A2单倍型个别的基部,解释这一个别能够与A2单倍型先人群体相干。别的,包含A2单倍型在内,约7000-2000年前这一区域至少存在有4种附属A单倍型的亚型,但是如今生活在这一区域的绝大年夜多半家犬属于A1单倍型,这一地区的家犬能够在2000年以来遭受了较大年夜的种群调换,特别是长江以北的地区。

  中国事世界上最早的农业中间之一,在中国南方地区栽种小米的汗青至少可以追溯到8000年前。研究发明在约7500年前家犬有一个明显的种群扩增,这与中国农业来源及人群数量扩大相吻合。这也暗示着A2支系的家犬能够敏捷地随着农业人群的扩大达到全部长江黄河道域。A2支系的家犬在中国现代家犬样品中非常罕见,然则在2000年以来被A1单倍群的个别大年夜量替换。在能够替换事宜产生之前,有一些A2类型的家犬曾经成功地向南分散到澳大年夜利亚、宁靖洋岛屿和向北分散到器械伯利亚的极地地区。殖平易近时代前的宁靖洋岛屿家犬能够从长江黄河道域来源,经西北亚大年夜陆印度尼西亚到宁靖洋深处的不合岛屿,这一支系的家犬能够随着前南岛语系人群和南岛语系人群一同分散。

  该研究初次体系地展开了中国现代家犬线粒体全基因组的研究任务。今后的研究还须要参加更多的东亚地区和相邻地区的现代样品的线粒体基因组和核基因组信息,特别是东亚南部的样品,可以或许对家犬的遗传汗青和分散道路有更了了的结论。

  本文的通信作者为付巧妹王国栋和胡松梅,第一作者为博士生张明。该研究取得国度重点研发筹划中科院计谋性先导科技专项(B类)国度天然迷信基金迷信摸索奖及霍华德休斯医学研究所的支撑。

  论文链接

  图1 A)收集的现代样品分布情况;(B)单倍型A的几种亚型在中国、西北亚、宁靖洋岛屿上的构成情况;(C)以A2单倍型构建的邻接法搜集关系图,浙江田螺山的个别处于中间肠位,代表A2单倍型的基本类群;(D)以单倍型A构建的贝叶斯体系退化树A2单倍型部分;(E)贝叶斯种群增长图。(张明供图)

图2 白色区域代表了澳洲野犬、新几内亚歌唱犬和殖平易近时代之前的宁靖洋家犬的能够来源地。(张明供图)

打印 义务编辑:叶瑞优

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